感染新冠后出现头疼眼睛疼，可能是由病毒侵袭、炎症反应、发热症状、睡眠障碍、心理因素等导致的。
1. 病毒侵袭：新冠病毒入侵人体后，可直接损伤神经组织，引起头疼和眼睛疼。此时，身体的免疫系统会启动防御机制，产生炎症反应，进一步加重疼痛症状。
2. 炎症反应：感染新冠会引发身体的全身性炎症，释放出多种炎症介质，如前列腺素、白三烯等，这些物质可导致血管扩张和神经末梢敏感性增加，从而引起头疼和眼睛疼。
3. 发热症状：新冠感染常伴有发热，体温升高会使脑血管扩张，颅内压增高，同时也会影响眼部的血液循环和神经功能，导致头疼和眼睛疼。
4. 睡眠障碍：感染新冠期间，身体不适、心理压力等可能导致睡眠质量下降或睡眠时间不足，进而引发头疼和眼睛疼。
5. 心理因素：对疾病的担忧、焦虑和恐惧等不良情绪，可能会通过神经内分泌机制影响身体的生理功能，导致头疼和眼睛疼等躯体症状。
总之，感染新冠后出现头疼眼睛疼的原因较为复杂。如果症状较轻，可通过休息、多喝水等方式缓解；若症状严重或持续不缓解，应及时就医，在医生的指导下进行治疗。同时，保持良好的心态和生活习惯，有助于促进身体的恢复。