怀孕时查出乙肝大三阳，需要综合多方面因素来处理，包括乙肝病毒的活跃程度、肝功能状况、孕妇的身体状况、胎儿的情况以及后续的预防措施等。
1. 乙肝病毒活跃程度：需要通过乙肝病毒 DNA 定量检测来明确。如果病毒载量高，可能会增加母婴传播的风险。
2. 肝功能状况：肝功能检查能反映肝脏的损伤程度。若肝功能异常，可能需要保肝治疗。
3. 孕妇身体状况：评估孕妇的整体健康状况，如是否存在其他基础疾病，这会影响治疗方案的选择。
4. 胎儿情况：定期进行超声检查，监测胎儿的发育情况。
5. 预防措施：在孕期，可根据具体情况在合适的孕周进行乙肝免疫球蛋白的注射，宝宝出生后也应及时接种乙肝疫苗和乙肝免疫球蛋白。
总之，怀孕时查出乙肝大三阳不必过于恐慌，应及时到正规医院就诊，遵循医生的建议进行全面评估和个体化治疗，以最大程度保障孕妇和胎儿的健康。