脖子上出现小肉粒且疼痛，可能由多种原因引起，如丝状疣、皮肤软纤维瘤感染、毛囊炎、皮脂腺囊肿伴感染、淋巴结炎等。

1. 丝状疣：是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的良性赘生物。当疣体受到摩擦或刺激时，可能会出现疼痛。治疗方法包括激光、冷冻、电灼等物理治疗，也可外用维 A 酸乳膏、咪喹莫特乳膏等药物，但需在医生指导下使用。

2. 皮肤软纤维瘤感染：通常表现为高出皮肤表面的带蒂增生物。若发生感染，会有疼痛症状。一般可通过手术切除，术后注意局部清洁，预防感染。

3. 毛囊炎：多由细菌感染毛囊引起，局部红肿、疼痛，可形成小肉粒样的丘疹。治疗上可外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等，症状严重时需口服抗生素，如头孢呋辛酯、阿莫西林等。

4. 皮脂腺囊肿伴感染：由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀而形成潴留性囊肿。当合并感染时会出现疼痛。治疗通常先控制感染，如使用抗生素，然后进行手术切除。

5. 淋巴结炎：当颈部淋巴结发生炎症时，可表现为局部肿大、疼痛，形似小肉粒。需明确病因，如细菌感染可用抗生素，如青霉素、头孢克洛等；病毒感染则以对症治疗为主。

脖子上出现小肉粒且疼痛的原因较多，如果症状持续不缓解或加重，应及时到正规医院就诊，明确诊断后进行针对性治疗。