肛瘘形成的原因较为复杂，主要包括肛周脓肿、肛门直肠损伤、肛裂反复感染、会阴部手术、结核杆菌感染等。
1. 肛周脓肿：这是肛瘘形成的最常见原因。当肛管直肠周围发生脓肿时，若脓肿自行破溃或切开引流后，脓腔逐渐缩小形成瘘管。
2. 肛门直肠损伤：比如肛门受到异物损伤、肛门体温计插入、肛门镜检查等医源性损伤，以及分娩时会阴撕裂等，都可能导致感染，进而形成肛瘘。
3. 肛裂反复感染：肛裂如果长期不愈合，裂口周围的炎症向皮下蔓延，形成皮下瘘。
4. 会阴部手术：如内痔注射误入肌层或手术后感染，也可能引发肛瘘。
5. 结核杆菌感染：结核病患者，尤其是肠道结核，容易并发肛瘘。
6. 克罗恩病：这是一种炎症性肠病，也可能导致肛瘘的发生。
7. 肛管直肠恶性肿瘤：肛管或直肠的恶性肿瘤破溃、感染后，有时也会形成肛瘘，但这种情况相对较少见。
总之，肛瘘的形成往往是多种因素共同作用的结果。一旦出现肛瘘相关症状，应及时到正规医院就诊，明确诊断，并采取合适的治疗方法。