上厕所小便时感觉尿道疼，可能由尿道炎、膀胱炎、尿路结石、前列腺炎、尿道损伤等因素引起。

1. 尿道炎：尿道炎是常见的泌尿系统感染疾病。病原体如细菌、支原体、衣原体等侵入尿道黏膜，引起炎症反应，导致尿道疼痛。患者常有尿频、尿急、尿痛等症状。治疗常使用抗生素，如左氧氟沙星、头孢呋辛酯、阿奇霉素等。同时，要多喝水，促进排尿，冲刷尿道。

2. 膀胱炎：多由细菌感染引起，炎症刺激膀胱和尿道，出现尿痛。还可能伴有下腹疼痛、血尿等。治疗以抗感染为主，可用阿莫西林、呋喃妥因、磺胺嘧啶等药物。

3. 尿路结石：结石在尿路中移动时，可能损伤尿道黏膜，引发疼痛。小的结石可通过多喝水、多运动自行排出。较大的结石可能需要体外冲击波碎石或手术治疗。

4. 前列腺炎：前列腺发生炎症时，可导致尿道疼痛，还可能有会阴部坠胀、尿频等表现。治疗包括使用抗生素如环丙沙星、多西环素等，以及α受体阻滞剂如坦索罗辛等，以改善症状。

5. 尿道损伤：外伤或医源性操作可能导致尿道损伤，从而引起疼痛。轻度损伤可通过休息、预防感染等方式恢复。严重损伤可能需要手术修复。

总之，上厕所小便时尿道疼可能由多种原因引起。如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，如尿常规、B 超等，以明确病因，并在医生的指导下进行治疗。