小肚子隐隐作痛可能由多种原因引起，如肠道问题、妇科疾病、泌尿系统感染、腹部肌肉拉伤、肿瘤等。
1. 肠道问题：常见的有肠痉挛、肠炎、肠梗阻等。肠痉挛多因饮食不当、着凉等导致肠道平滑肌强烈收缩；肠炎可能是细菌、病毒或寄生虫感染；肠梗阻则可能是肠道异物、粘连等引起。这些疾病除了腹痛，还可能伴有腹泻、呕吐、腹胀等症状。
2. 妇科疾病：如盆腔炎、附件炎、子宫内膜异位症等。盆腔炎通常是病原体感染；附件炎多与盆腔炎症蔓延有关；子宫内膜异位症是子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位。患者可能有白带异常、月经失调等表现。
3. 泌尿系统感染：尿道炎、膀胱炎等较为常见。多由细菌逆行感染所致，除了下腹隐痛，还常有尿频、尿急、尿痛等症状。
4. 腹部肌肉拉伤：过度运动或不当的姿势可能导致腹部肌肉拉伤，引起疼痛，一般有明确的外伤史。
5. 肿瘤：下腹的肿瘤，如卵巢癌、结肠癌等，早期可能表现为隐痛，随着病情进展，疼痛会加重，还可能伴有消瘦、乏力等全身症状。
小肚子隐隐作痛的原因较为复杂，如果疼痛持续不缓解或伴有其他严重症状，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，如腹部超声、CT、血常规、大小便常规等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。