早上起来嗓子吞咽难受很疼，可能是由以下因素导致的，如环境干燥、咽喉炎、扁桃体炎、感冒、胃食管反流病等。

1. 环境干燥：夜间睡眠时，房间内空气过于干燥，会使咽喉部黏膜水分流失，导致晨起时嗓子吞咽难受和疼痛。这种情况通常通过增加室内湿度，如使用加湿器，可得到缓解。

2. 咽喉炎：咽喉部发生炎症，多由病毒或细菌感染引起。患者除了嗓子疼痛，还可能有咽干、咽痒、咽部异物感等症状。治疗上，可使用利巴韦林、阿莫西林等药物。同时，要注意多喝水，少说话，避免食用辛辣刺激性食物。

3. 扁桃体炎：扁桃体发炎时，会出现嗓子疼痛，吞咽时疼痛加剧。常见致病菌为链球菌。治疗常选用青霉素、头孢呋辛等抗生素。如果扁桃体炎反复发作，可能需要手术切除扁桃体。

4. 感冒：病毒感染引起的感冒，会导致咽喉部黏膜充血、水肿，引起嗓子疼痛。一般还伴有鼻塞、流涕、咳嗽等症状。可使用复方氨酚烷胺胶囊等药物对症治疗。

5. 胃食管反流病：胃酸反流刺激食管和咽部，也会引起嗓子疼痛。患者可能有烧心、反酸等症状。治疗常用奥美拉唑、多潘立酮等药物，同时要注意调整饮食习惯，避免睡前进食。

总之，早上起来嗓子吞咽难受很疼的原因较多，如果症状持续不缓解或加重，应及时到正规医院就诊，明确病因，并在医生的指导下进行治疗。