性行为后有时小腹痛，可能由多种原因引起，如动作过于剧烈、妇科或男科炎症、盆腔器官病变、心理因素、性传播疾病等。
1. 动作过于剧烈：性生活时动作幅度过大或过于粗暴，可能导致生殖器官受到过度刺激和损伤，引起小腹痛。这种情况下，一般休息后可缓解。
2. 妇科或男科炎症：女性可能患有盆腔炎、宫颈炎等，男性可能存在前列腺炎等炎症。炎症会使生殖器官处于充血状态，性生活刺激会加重充血，引发疼痛。
3. 盆腔器官病变：如女性的子宫内膜异位症、卵巢囊肿，男性的精索静脉曲张等，在性生活时可能因器官位置改变或受到挤压而产生疼痛。
4. 心理因素：紧张、焦虑等不良情绪可能导致生殖器官肌肉收缩不协调，从而引起疼痛。
5. 性传播疾病：如淋病、梅毒等，会引起生殖器官的炎症和损伤，导致性生活后腹痛。
总之，性行为后小腹痛的原因较为复杂。如果疼痛持续不缓解或伴有其他不适症状，如发热、白带异常、尿频尿急等，应及时到正规医院就诊，进行相关检查，如妇科或男科超声、分泌物检查等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，在性生活中应注意保持良好的心态，动作适度。