婴儿肛门囊肿的痊愈时间受多种因素影响，如囊肿大小、治疗方式、婴儿自身免疫力、日常护理以及是否存在基础疾病等。
1. 囊肿大小：较小的肛门囊肿，经过及时有效的治疗和护理，可能在 1 - 2 周内逐渐恢复。较大的囊肿可能需要 3 - 4 周甚至更长时间。
2. 治疗方式：如果采用保守治疗，如坐浴、局部涂抹药物等，恢复时间相对较长，可能需要 2 - 4 周。若进行手术治疗，术后伤口愈合良好的情况下，一般 2 - 3 周可痊愈。
3. 婴儿自身免疫力：免疫力较强的婴儿，身体对抗炎症和促进组织修复的能力较好，恢复时间可能较短，大约 2 - 3 周。免疫力较弱的婴儿则可能需要 3 - 5 周甚至更久。
4. 日常护理：家长能保持婴儿肛门部位清洁、干燥，及时更换尿布，避免摩擦和感染，有助于缩短恢复时间，大概 2 - 3 周。反之，可能延长恢复时间。
5. 是否存在基础疾病：若婴儿同时患有其他疾病，如营养不良、糖尿病等，会影响身体的恢复能力，可能使肛门囊肿的痊愈时间延长至 4 - 6 周甚至更久。
总之，婴儿肛门囊肿的痊愈时间因人而异。家长要密切关注婴儿的症状变化，严格按照医生的建议进行治疗和护理，如有异常应及时就医。