灰指甲主要由皮肤癣菌、酵母菌、非皮肤癣菌性霉菌等引起，常见的有红色毛癣菌、须癣毛癣菌、念珠菌、曲霉、青霉等。
1.皮肤癣菌：这是导致灰指甲最常见的菌类，其中红色毛癣菌最为多见，其次是须癣毛癣菌等。皮肤癣菌具有较强的侵袭性，容易侵犯指甲。
2.酵母菌：比如念珠菌，在特定条件下也会引发灰指甲，尤其在免疫功能低下或长期使用抗生素的人群中较易出现。
3.非皮肤癣菌性霉菌：常见的有曲霉、青霉等。这类霉菌引起的灰指甲相对较少，但在一些特殊情况下也可能致病。
4.混合感染：部分灰指甲病例可能由两种或两种以上的菌类混合感染导致，使得病情更为复杂。
5.其他少见菌类：还有一些较为罕见的菌类也可能引起灰指甲，但在临床上相对不常见。
总之，灰指甲的致病菌种类较多，且不同菌类导致的灰指甲症状和治疗方法可能有所差异。一旦发现指甲异常，应及时就医，明确病因，进行针对性治疗。