胚胎停孕的原因较为复杂，常见的有胚胎自身异常、母体因素、父亲因素、环境因素和免疫因素等。

1.胚胎自身异常：胚胎染色体异常是导致胚胎停孕的重要原因。在早期自然流产中，约 50% - 60% 是由胚胎染色体异常引起。常见的染色体异常包括染色体数目异常，如三体、单体；染色体结构异常，如缺失、重复、易位等。

2.母体因素：

内分泌失调：如黄体功能不全、多囊卵巢综合征、高泌乳素血症、甲状腺功能异常（甲状腺功能减退或亢进）、糖尿病血糖控制不佳等，都可能影响胚胎的正常发育。

生殖道异常：子宫畸形（纵隔子宫、单角子宫、双角子宫等）、宫腔粘连、子宫肌瘤、子宫内膜息肉等，会影响胚胎着床和发育。

全身性疾病：孕妇患有严重的感染、高热、贫血、心力衰竭、慢性肝肾疾病等，会影响子宫和胎盘的血液供应，导致胚胎停孕。

免疫功能异常：自身免疫性疾病，如系统性红斑狼疮、抗磷脂综合征等，会产生抗体攻击胚胎，导致胚胎停孕。

不良生活习惯：孕妇长期吸烟、酗酒、滥用药物、接触有毒有害物质（如甲醛、苯、放射线等），都可能增加胚胎停孕的风险。

3.父亲因素：精子染色体异常、精子活力差、畸形率高等，也可能导致胚胎质量不佳，从而引起胚胎停孕。

4.环境因素：过多接触化学物质（如铅、汞、镉等）、物理因素（如高温、噪音、放射线等），都可能影响胚胎发育。

5.免疫因素：母体对胚胎的免疫耐受失衡，产生免疫排斥反应，也会导致胚胎停孕。

总之，胚胎停孕是由多种因素共同作用的结果。如果发生胚胎停孕，建议及时就医，查明原因，为下次妊娠做好准备。同时，在备孕期间，夫妻双方应保持良好的生活习惯，做好孕前检查，以减少胚胎停孕的发生风险。