自身抗体种类繁多，常见的有抗核抗体、类风湿因子、抗甲状腺过氧化物酶抗体、抗线粒体抗体、抗中性粒细胞胞浆抗体等。
1.抗核抗体：是一组对细胞核内的 DNA、RNA、蛋白或这些物质的分子复合物产生的自身抗体。其在系统性红斑狼疮、干燥综合征等自身免疫病中常见。
2.类风湿因子：主要见于类风湿关节炎患者，但也可在其他自身免疫病及感染性疾病中出现。
3.抗甲状腺过氧化物酶抗体：常见于桥本甲状腺炎等甲状腺自身免疫性疾病，对甲状腺细胞具有损伤作用。
4.抗线粒体抗体：多见于原发性胆汁性肝硬化，有助于疾病的诊断。
5.抗中性粒细胞胞浆抗体：与血管炎类疾病，如肉芽肿性多血管炎等关系密切。
自身抗体的检测对于自身免疫性疾病的诊断、病情评估和治疗监测具有重要意义。但单一自身抗体阳性不能确诊某种疾病，需结合临床症状、体征及其他检查结果综合判断。