男性生育功能检查的费用因地区、医院、检查项目等因素而异。一般来说，常见的检查项目包括精液常规分析、生殖系统超声、性激素检查等，总体费用在几百元到上千元不等。
1.地区差异：不同地区的医疗消费水平有所不同。经济发达地区的费用可能相对较高，而经济欠发达地区的费用可能相对较低。
2.医院级别：三级甲等医院的设备和技术相对更先进，收费可能会高于二级医院和基层医院。
3.检查项目：精液常规分析一般在几十元到百元左右；生殖系统超声，如睾丸、附睾、精索静脉等，每项可能在一百多元；性激素检查，包括睾酮、促卵泡生成素等，费用大概在二三百元。
4.特殊检查：如果需要进行染色体检查、Y 染色体微缺失检测等特殊项目，费用会更高，可能在千元以上。
5.复诊和复查：如果初次检查结果异常，需要进行复诊和进一步复查，也会增加费用。
总之，男性生育功能检查的费用受多种因素影响。建议前往正规医院，医生会根据具体情况制定合适的检查方案，并告知大致费用。