肛门脓肿手术后的疼痛持续时间因人而异，一般受到手术创口大小、个人疼痛耐受程度、术后护理情况、是否出现并发症以及患者的基础健康状况等因素的影响。通常来说，疼痛可能会持续数天至数周不等。
1. 手术创口大小：创口越大，损伤的组织越多，疼痛持续时间可能越长。较小的创口可能在一周左右疼痛明显减轻，而较大的创口可能需要两三周甚至更长时间。
2. 个人疼痛耐受程度：每个人对疼痛的感受和耐受能力不同。耐受程度低的人可能会觉得疼痛持续时间较长，而耐受程度高的人可能相对较短。
3. 术后护理情况：术后保持肛门清洁、按时换药、避免剧烈运动等良好的护理措施有助于减轻疼痛和促进伤口愈合。若护理不当，如伤口感染，会延长疼痛时间。
4. 是否出现并发症：若术后出现出血、感染等并发症，会加重疼痛，使疼痛持续时间延长。
5. 患者的基础健康状况：患有糖尿病、营养不良等基础疾病的患者，伤口愈合较慢，疼痛持续时间可能较长。
总之，肛门脓肿手术后的疼痛持续时间没有固定标准。患者应严格按照医生的建议进行护理，如有异常疼痛或其他不适，及时就医复查。