脑干脑炎的康复时间因人而异，受多种因素影响，如病情严重程度、治疗及时性和有效性、患者自身免疫力、是否有并发症以及后续的康复治疗等。
1. 病情严重程度：病情较轻的患者，可能在数周至数月内恢复；而病情严重者，恢复时间可能长达半年甚至更久。
2. 治疗及时性和有效性：如果能在发病早期得到准确诊断和有效治疗，如使用糖皮质激素（地塞米松、泼尼松、甲泼尼龙）、抗病毒药物（阿昔洛韦、更昔洛韦、利巴韦林）、免疫球蛋白等，通常恢复会相对较快。
3. 患者自身免疫力：免疫力较强的患者，身体对抗炎症和修复损伤的能力较好，康复时间可能较短；免疫力差的患者则可能需要更长时间。
4. 是否有并发症：若出现呼吸衰竭、肺部感染、颅内压增高等并发症，会延长康复时间。
5. 后续的康复治疗：积极进行康复训练，包括物理治疗、言语治疗、吞咽功能训练等，有助于促进神经功能恢复，缩短康复时间。
总之，脑干脑炎的康复时间难以确切预估，患者和家属需要保持耐心，积极配合治疗和康复，以争取更好的预后。