衣原体阳性患者吃药治疗的时间因人而异，通常取决于感染的严重程度、患者的自身免疫力、所使用的药物、是否存在并发症以及治疗的依从性等。
1. 感染严重程度：如果感染较轻，可能用药 1-2 周；若感染严重，可能需要 3-4 周甚至更长时间。
2. 患者自身免疫力：免疫力强的患者，对药物反应较好，治疗时间相对较短；免疫力弱的患者，恢复较慢，治疗时间可能延长。
3. 所使用的药物：常用的治疗衣原体感染的药物有阿奇霉素、多西环素、红霉素等。不同药物的药效和疗程可能有所不同。例如，阿奇霉素一般用药 3-5 天为一个疗程；多西环素通常需要连续用药 7-14 天；红霉素的疗程可能在 10-14 天。
4. 是否存在并发症：若同时伴有其他感染或并发症，如尿道炎、附睾炎等，治疗时间会相应延长。
5. 治疗的依从性：患者严格按照医嘱按时、按量服药，治疗效果会更好，所需时间可能相对较短；反之，若不规范用药，可能导致治疗失败或延长治疗时间。
总之，衣原体阳性患者应在医生的指导下规范治疗，定期复查，以确定合适的治疗时间和效果。治疗期间要避免性生活，注意个人卫生，增强自身免疫力。