长期手淫三年后身体恢复的时间因人而异，受多种因素影响，包括手淫频率、个人体质、生活习惯、心理状态和是否存在基础疾病等。
1. 手淫频率：如果手淫频率过高，对身体造成的损害较大，恢复时间可能较长；反之，恢复相对较快。
2. 个人体质：体质较好的人，身体自我修复能力较强，恢复时间可能较短；而体质较弱的人恢复时间会延长。
3. 生活习惯：保持规律作息、均衡饮食、适量运动和戒烟限酒等良好生活习惯，有助于身体恢复；反之，不良生活习惯会延缓恢复进程。
4. 心理状态：积极乐观的心理状态有利于身体的恢复，若长期处于焦虑、抑郁等不良情绪中，可能影响恢复时间。
5. 基础疾病：若本身存在前列腺炎、尿道炎等泌尿生殖系统疾病，会增加恢复的难度和时间。
总之，长期手淫三年后身体的恢复时间难以确切估计，关键在于及时戒除手淫，养成良好的生活和心理习惯，并积极治疗可能存在的基础疾病。如果对身体恢复情况存在疑虑，建议前往正规医院男科或泌尿科咨询专业医生。